男性与女性生殖区域的一大差别是，男性有两个开口，一个是在阴茎顶端排出尿液与精液的口，另外一个是在阴囊后的肛门口；而女性有三个口：尿道口、阴道口和肛门口。男性生殖器官也分内、外生殖器官两部分。外生殖器官包括阴阜、阴囊和阴茎。
阴阜 阴阜为耻骨前方的皮肤和丰富的皮下脂肪组织。成年人皮肤上有阴毛，皮下组织有皮脂腺和汗腺。青壮年时阴阜显著隆起，中年以后脂肪组织减少下陷，老年则萎缩变平。青春期的阴毛发生是男性第二性征的标志之一，雄激素的缺乏表现为阴毛稀少或不发育。
阴茎 男性外生殖器中，最明显的是阴茎，包括阴茎轴及龟头。阴茎具有排尿、性交、射精三大功能。从外形上看，阴茎有松弛和勃起两种状态。阴茎后部为阴茎根、中部为阴茎体呈圆柱形，体的前端膨大部为阴茎头（或称龟头）。阴茎尖端有尿道外口。阴茎的头亦称为龟头，也含有海绵组织，尿道口就位于充头内。在阴茎轴与龟头之间是冠状构。龟头、冠状构与系带都充满神经末梢。对刺激是很敏感的。
阴茎内部由3个平行的长柱状海绵体组成；它有血管及神经分布在这儿，阴茎上面两个海绵体称阴茎海绵体，下面一个称尿道海绵体，尿道从中穿过。平常排尿和精子均由此地出入，但它们不会搞混，故不须担心小便时，精液也会跟着一起出来。当海绵体内的腔充血时，阴茎即变得粗而硬，这就是性兴奋时阴茎勃起的原因。一般男性在儿童时期，阴茎较小，一直到了青春期阴茎会开始成长，且颜色加深。阴茎的长短大小有一定范围，有人拿来作为评价性能力的标准，这是不正确的。阴茎的大小和身材高矮、胖瘦，五官大小一样，存在众多差别，且与民族、种族等都有有关系。长短不一，粗细不等这属正常生理现象。常态下阴茎长度范围为4.5－8.6厘米，许多因素都可能影响平时阴茎的大小，包括身体脂肪过多、天气过冷、压力情境。如果阴茎在青春期后短于5厘米，而且没有勃起功能，特别是第二性征发育不良，无精子，无生育能力，才可以认为阴茎发育不正常。一般来说，阴茎的长短和粗细的大小并不能代表其功能的强弱。不能做为评价性能力的标准。只要在正常生理范围内，不会影响今后的性生活。
阴茎头和与体的连接处有阴茎包皮，如包皮过长而包着阴茎头不能翻起时，就形成为包茎。包茎不仅影响性生活，还能引起炎症，甚至癌症。因此，主张将多余的包皮用手术切除。
阴囊 阴囊位于会阴之间，是由皮肤、肌肉等构成的柔软而富有弹性的袋状囊，把睾丸、附睾、精索等兜在腹腔外、两胯间。阴囊内有阴囊隔，将阴囊内腔分成左右两部，各容纳一个睾丸和附睾。当遇冷、运动或性刺激时，阴囊的肌肉就会收缩，以拉高明囊内的睾丸，以便靠近身体。这种使睾丸更靠近或更远离身体的移动，对睾丸来说是很重要的。因为睾丸必须维持在比体温稍低的温度中，遇冷或遇热都会造成精子减少。若长期暴露在过冷的环境中，可能就会因此造成不孕，也会增加得到睾丸癌的机率。
阴囊皮肤有明显的色素沉着，长有稀疏的阴毛。阴囊皮肤薄而柔软，并有很多的褶皱，如果将它展平，表面积会增大许多。阴囊皮肤还有丰富的汗腺，容易出汗，经常是湿漉漉的。
阴囊的主要功能有：保护睾丸、调节温度、有利于精子的产生和贮存等。
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